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Software de colonia de ratones

Software de colonia de ratones


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Estoy buscando un buen programa de censo de colonias de ratones que rastree los ratones que tenemos en el laboratorio, el éxito de reproducción de los criadores, los linajes, el acceso de múltiples usuarios, etc. Jackson Labs tiene un programa que hace esto, pero es engorroso y un poco caro ( softmouse también es una opción, aunque costosa). Supuse que, dado que la gestión de colonias es tan generalizada, debe haber una buena pieza de software para lidiar con esto, pero la mayoría no ha tenido suerte. También sería genial si actualmente se trata de un software compatible que no esté desactualizado y no sea gratuito o que se venda a un precio relativamente económico. Gracias.


Aquí hay una lista de programas que podrían funcionar:

  • E-mouse Lab: http://e-mouselab.com, parece ser el que mejor se ajusta a sus necesidades.
  • ZooEasy: http://standalone.zooeasy.com/en/pedigree-software/breeding-mice/breeders/index.html, más barato, bueno para la cría y pedigrí.
  • LabGuru: http://www.labguru.com, parece muy profesional y también excelente para muestras de ratones.
  • MouseHouseApp: http://www.mousehouseapp.com, esta es una aplicación para iPhone y iPad, por lo que sería bueno en el laboratorio, pero depende de si tiene o no un dispositivo iOS.

Además, por lo que encontré, Jackson Labs ofrece programas gratuitos de gestión de colonias de ratones. Parece que es engorroso, pero también un gran programa.

Agregaré más cuando tenga tiempo.


Software Mouse Colony - Biología

Base de datos y software de administración de colonias de Internet: mejore la productividad, administre las operaciones diarias, establezca inventarios precisos de sus colonias de mouse y reduzca los costos operativos de investigación, reproducción y reproducción de su laboratorio con el software de base de datos de administración de colonias de mouse SoftMouse.NET.

  • Seguimiento del mantenimiento de colonias y reproducción de ratones
  • Mantenimiento transparente de registros de experimentos con mouse
  • Creación de documentos electrónicos
  • Funciones de gestión y protección de datos
  • Funciones administrativas
  • Acceso y comunicación de datos basados ​​en la web
  • . y muchas más funciones

Con la base de datos de colonia de mouse de SoftMouse.NET, el usuario solo tiene que ingresar los datos de registro de su mouse una vez. Un beneficio inmediato es que el usuario tiene la capacidad de ver los mismos datos en múltiples vistas dependiendo de lo que esté buscando. Las características principales de la base de datos de administración del software SoftMouse DB Mouse Colony se han organizado para proporcionar estas múltiples vistas en forma de varias tablas y listas.

El software de gestión de colonias de ratones SoftMouse.NET V4 tiene opciones para rastrear ratones, jaulas, destete, reproducción y colonias de ratones / ratones transgénicos y noqueados.

Únase a la comunidad de SoftMouse DB y descubra los beneficios de utilizar un sistema de administración de bases de datos relacionales para administrar su investigación de colonias de ratones.

Se requiere la creación de una cuenta de PRUEBA GRATUITA para acceder a utilizar SoftMouse DB.

Iseehear Inc. (ISH) es una empresa privada de software y bases de datos de Internet que desarrolla soluciones de gestión de datos novedosas y patentadas para la comunidad de investigación biomédica. Las soluciones de tecnología de la información basadas en Internet de Iseehear proporcionan la plataforma y las tecnologías habilitadoras, que complementan los avances en la investigación genética y genómica y facilitan la captura, registro, protección y almacenamiento de datos de investigación y propiedad intelectual.


Sistema de gestión de colonias de ratones

Después de un extenso proceso de evaluación de software con la participación de todo el campus, UCSF ha finalizado la selección de un nuevo Sistema de gestión de colonias de ratones. Esta solución proporcionará un valor significativo al personal del laboratorio en la sala del ratón y a los IP en sus esfuerzos de planificación.

UCSF tiene alrededor de 300 investigadores principales diferentes aprobados actualmente para la investigación con ratones en UCSF y 425 protocolos de ratón activos. Nuestros ratones son como pacientes en el hospital: necesitan ser rastreados y manipulados de forma individual. El proceso actual se basa principalmente en la entrada manual, a menudo en papel y notas a lápiz, que luego se transfieren a una hoja de cálculo de Excel. Esto da como resultado un proceso lento, propenso a errores, no susceptible de una gestión de la información de calidad y distrae del valioso trabajo del personal de la sala del ratón y sus IP.

Los beneficios de la nueva solución de software incluirán:

  • Una herramienta de gestión de colonias disponible para todo el personal de laboratorio de UCSF, entregada en tableta y escritorio
  • Una consolidación de los datos del ratón del investigador para mejorar la gestión de proyectos basada en laboratorio
  • Integración con bases de datos en el sitio y de Industry Mouse y sistemas UCSF relacionados, si lo desea el investigador
  • Plataforma para análisis de pedigrí
  • Vista confiable del uso que hace el investigador de los recursos de animales de laboratorio por parte del laboratorio
  • Mejora del proceso empresarial para la calidad de los datos y el flujo de trabajo
  • Ahorro de costos (la visibilidad permite decisiones con mentalidad fiscal)
  • Reducción de errores
  • Ratones más prolíficos
  • Mayor visibilidad de los activos de la colonia en todos los laboratorios, si se desea

El proyecto está comenzando la fase de diseño. El objetivo es lanzar la primera versión de software a los usuarios antes de que finalice el año calendario.

El proyecto está patrocinado por el Comité de Gobierno de TI sobre Tecnología de Investigación (CRT). El proyecto está dirigido por un Comité Directivo del Sistema de Gestión de Colonias de Ratones cuyos miembros son:

  • Chris Allen, profesor asistente, Instituto de Investigación Cardiovascular y Departamento de Anatomía, Facultad de Medicina
  • Mark Anderson, profesor, Centro de Diabetes, Facultad de Medicina
  • Jeff Bush, profesor asistente, biología celular y tisular, Facultad de Medicina
  • Kathy Johnson, Gerente de Proyectos de TI, Centro de Recursos para Animales de Laboratorio (LARC), Oficina de Investigación
  • Lewis Lanier, profesor y presidente, Departamento de Microbiología e Inmunología, Facultad de Medicina (Presidente del Comité Directivo)
  • Michael McManus, profesor asociado, Centro de Diabetes, Facultad de Medicina
  • James Wilkerson, Director Ejecutivo, Centro de Recursos para Animales de Laboratorio (LARC), Oficina de Investigación

Para obtener más información, comuníquese con Mara Fellouris en la Oficina de Administración de Programas de UCSF.


R / Biología, ¿pueden ayudarme a mejorar el manejo de las colonias de ratones? ¿Por favor?

Así que recientemente se me ha encomendado la tarea de administrar mi laboratorio y la colonia de ratones # x27s. También se me ha dado la misión opcional (+5 puntos para completar la misión de promoción, que da +5.000 de salario y +3 beneficios) de mejorar la base de datos de la colonia.

Actualmente, los datos se guardan en una carpeta, los cambios en los que luego se transcriben a un archivo de Excel muy grande, que a su vez se imprime en forma actualizada y se utiliza para completar la carpeta. Este proceso es ineficiente, hace que la clasificación de datos sea una molestia en el mejor de los casos y no es particularmente susceptible de recibir alertas de acciones que deben realizarse.

Mi PI sugirió obtener y usar un iPad para editar los datos del archivo de Excel mientras estaba en las salas de colonia, pero, por mucho que me gustaría un iPad, no creo que esta sea la solución. Sugerí, a su vez, una tableta resistente con un escáner de código de barras incluido, como se usa en hospitales y entornos similares. Sin embargo, hasta el momento, el precio no se ha determinado y podría resultar prohibitivo para este nuevo método de entrada de datos.

Independientemente del método físico de entrada de datos utilizado, también me gustaría mejorar el almacenamiento de datos. En el pasado, trabajé para el museo Peabody y usé un software llamado eMu (museo electrónico). Este software está profundamente dominado por esta aplicación y un poco por encima de mi cabeza con respecto a la configuración. En cambio, he estado usando el acceso, que debería funcionar bien, una vez que aprenda a diseñar correctamente las bases de datos.

Me preguntaba si alguien podría darme consejos, palabras de sabiduría, historias de advertencia, etc. sobre la gestión de sus colonias de animales, así como sobre el software y el hardware que utilizan.

tldr si administra una colonia de animales utilizando algo más eficiente que las tabletas de piedra inscritas, por favor avise.

EDITAR: Así que estoy menos preocupado por el hardware que utilizaré y quiero centrarme en el software de la base de datos. Como mencionaron varias personas, hay muchos programas de bases de datos relacionales, ya sean genéricos (como FM pro, access, bento, etc.), así como programas diseñados específicamente para la gestión de colonias. Como hay una docena más o menos diseñada específicamente para la administración, y como no quiero instalar 10 pruebas gratuitas y pasar 10 horas trabajando con cada programa, ¿alguien puede comentar qué software de BASE DE DATOS usa y sus pros / contras? ? ¡Gracias!


¿Por qué probar SoftMouse?

Escenario 1

"Lunes por la mañana" con SoftMouse DB en Mouse House

Comencé a ingresar las nuevas camadas para el laboratorio en SoftMouse. Mi rutina es ir a Matings, encontrar el apareamiento y hacer clic en New Litter, agregar la fecha y enviar. Luego hago clic en New Litter y agrego mi comentario sobre qué hacer con esta nueva arena y presiono guardar. Volver a los Matings y añadir la siguiente camada, repetir. Hecho. ¡Vaya, eso siempre es tan rápido, me encanta!

El veterinario ha llegado para examinar las colonias. Ella es realmente agradable. Tengo SoftMouse abierto. Ella pregunta qué estoy haciendo. Le muestro algunos conceptos básicos de SoftMouse y le digo que por eso soy tan eficiente en mi trabajo. No podría cuidar las 43 líneas de mouse tan bien como lo hago sin SoftMouse. Está muy impresionada por lo poco que le he mostrado, pero lo más importante es que está impresionada con la forma en que estoy usando la base de datos y lo que puede hacer por el manejo de mi colonia. Ella pregunta es por qué tanta gente está usando el software en la universidad "se ve tan bien".

Continué explicando que antes de SoftMouse pasaba mucho de mi tiempo planificando mi semana de trabajo, haciendo listas, descifrando la información de la hoja de cálculo para proyectos y ahora puedo calcular la eficiencia de reproducción rápidamente, mis listas se generan para mí en SoftMouse y mi semana de trabajo es planeado en 10 minutos.

SoftMouse siempre se vuelve más fácil de usar, más rápido y más poderoso para ver la colonia virtualmente. El grupo de investigadores para el que trabajo ha ahorrado miles de dólares al tener una base de datos a la que todos pueden acceder y planificar experimentos, por lo que estamos criando para experimentos, no criando y tratando de averiguar para qué usar los ratones después del hecho. Mi salario se utiliza para trabajar en la colonia sin duplicar archivos, tratar de extraer información de la colonia de una hoja de cálculo y pasar mucho tiempo tratando de averiguar qué significa la información en la hoja de cálculo.

Visite la base de datos de SoftMouse y descubra los beneficios de la gestión de colonias de una casa de ratón digital en la nube móvil.

Escenario n. ° 2

Vaya a la lista de basura en SoftMouse DB. Los destetes vencidos o vencidos son lo que estoy etiquetando hoy. Han sido destetados por el personal de barrera y ahora los ingresaré en el sistema, les daré números de etiqueta y los destetaré de acuerdo con el momento en que el personal destetó a los cachorros.

Haga clic en SID para seleccionar la camada que deseo agregar y destetar. Seleccione la acción desplegable, agregue ratones, seleccione machos agregue el número total de cachorros en la camada. Seleccione editar cachorros. Seleccione los machos que se convertirán en hembras, elija editar el sexo, seleccione la hembra y solicite y permanezca. Agregue el número de etiqueta para iniciar la secuencia, seleccione todas las casillas de verificación, aplique y permanezca. Seleccione acción, destete a los cachorros, haga clic en el calendario y elija la fecha correcta. En el capó abro las jaulas, etiqueto y recorto a los ratones. Los clips van en los tubos que he etiquetado. Hecho. Seleccione aplicar y mover. El ratón está enjaulado correctamente. Listo, me encanta que el sistema tenga un sistema predeterminado para enjaular y sea lo suficientemente intuitivo como para enjaular mis ratones de manera uniforme, tal como lo haría yo en realidad, muy bueno. Siguiente juego de jaulas para etiquetar. Repita los pasos anteriores.

Escenario n. ° 3

Es genial poder planificar la reproducción y el flujo de trabajo desde donde elijamos

Utilizo SoftMouse cuando estoy realizando mi trabajo, pero no he entrado en detalles que mi colega que administra / asiste en mi flujo de trabajo para sus 14 líneas de ratón desde la comodidad de su sala de estar. Principalmente los jueves y lunes por la mañana con una computadora portátil conectada a SoftMouse y un café a su lado. No puedo comer ni beber en el laboratorio o en las habitaciones de mi casa del ratón, por lo que es genial poder planificar la reproducción y el flujo de trabajo desde donde elijamos. SoftMouse está disponible para nosotros las 24 horas del día, los 7 días de la semana, y como estoy en las colonias de la casa del ratón toda la semana, los datos siempre están actualizados. Lo más cerca posible del tiempo real.

Escenario n. ° 4

Cómo uso SoftMouse DB?

Estoy conectado a SoftMouse todos los lunes, martes y miércoles de 9:30 a 10 a.m. a 3/3:30 p. M. Estoy en el sistema todos los días con al menos dos nombres de usuario por día. Utilizo la mayoría de los aspectos de SoftMouse a diario y busco actualizaciones de mis colegas en el sistema usando los filtros.


SoftMouse DB Solución de gestión de colonias de ratones

La plataforma de investigación basada en la web de Iseehear y las tecnologías habilitadoras complementan los avances en la investigación farmacéutica y genómica y facilitan la captura, protección y almacenamiento de datos de investigación y preclínicos.

El producto estrella de Iseehear, SoftMouse DB, es un programa de software de cría de ratones y mantenimiento de colonias basado en la web que está diseñado para investigadores preclínicos para permitirles aumentar la eficiencia y la productividad en el manejo de sus ratones, jaulas y experimentos relacionados con ratones.

El SoftMouse DB El sistema de mantenimiento de registros proporciona características centrales diseñadas para organizaciones de investigación de clase mundial que realizan experimentos preclínicos y con modelos de ratón en una amplia gama de campos de investigación en ciencias de la vida que incluyen oncología, neurología, investigación con células madre, enfermedades infecciosas y manejo del dolor crónico.

  1. Seguimiento de cría de ratones y mantenimiento de colonias
  2. Mantenimiento transparente de registros de experimentos con mouse
  3. Respaldo, almacenamiento y acceso seguro de datos basados ​​en la web
  4. Optimización de la información sobre colonias de ratones
  5. Reducción significativa de los requisitos de mantenimiento de TI
  6. Aumento general de la eficiencia de la investigación y la asignación del tiempo

Iseehear ofrece un sistema basado en roles altamente configurable que ayudará a garantizar que la gestión de la investigación responda mejor a las necesidades del investigador principal y que se proporcionen los datos adecuados a las personas adecuadas en el momento adecuado, lo que dará como resultado una evaluación general. mayor eficiencia y menores costos.

El producto estrella de Iseehear, SoftMouseDB, es un programa de software de cría de ratones y mantenimiento de colonias basado en la web que está idealmente diseñado para investigadores académicos y grupos de laboratorios, para permitirles aumentar la eficiencia y la productividad en el manejo de sus líneas de ratones, jaulas y experimentos relacionados con ratones.


Gestión de colonias de ratones

Los siguientes parámetros se ajustan a la mayoría de las cepas comunes de ratones, pero tenga en cuenta que la reproducción de ratones puede ser muy específica de la cepa. Siempre que sea posible, obtenga información de alguien que tenga experiencia con una cepa en particular.

edad de madurez sexual: 5-8 semanas
esperanza de vida reproductiva: 7-12 meses
ciclo estral: 4-5 días
período de gestación: 19-21 días
tamaño medio de la camada: 6-8 cachorros
edad mínima de destete: alrededor de 18-28 días
La edad de destete es específica de la cepa Los ratones C57BL / 6 se desarrollan más lentamente y generalmente requieren una edad de destete de 24-28 días.

Sistema de registro de reproducción de ratones: The Breeder Card

Los ratones se pueden emparejar a las 6-8 semanas de edad. Cuando los animales se emparejan por primera vez, cree una "tarjeta de criador" que incluya un número exclusivo para el emparejamiento de estos dos animales. Escriba el número único en la esquina superior derecha de la tarjeta de criador. Este número está en orden de conteo secuencial a partir de 1. Use un conjunto separado de números por cepa, de modo que pueda ver rápidamente el número más alto y saber cuántas parejas reproductoras tiene de una cepa determinada.

Registre lo siguiente en cada tarjeta de criador:

Fecha de emparejamiento: los ratones de fecha se emparejan para la reproducción
Fecha de separación: si se separa, el macho de la fecha se retira de la jaula de la hembra.
Fecha de nacimiento: registre la fecha de nacimiento de los cachorros nacidos

  1. Nacidos: número total de cachorros nacidos (ayuda a rastrear la productividad de la pareja)
    ♂ - número de machos que han sobrevivido al destete (opcional)
    ♀ - número de hembras que han sobrevivido al momento del destete (opcional)
    Fecha de destete: fecha de destete de la camada

Repita los pasos para cada camada nacida.

Cuando reemplazar a los criadores

cuando los ratones no producen una camada en 8 semanas de apareamiento o dentro de las 8 semanas de la última camada
cuando los ratones no crían 2-3 camadas consecutivas
cuando el tamaño de la camada disminuye rápidamente durante 2 camadas consecutivas

La lista de verificación de rendimiento de reproducción de ratones de RARC se puede utilizar para identificar problemas potenciales en su colonia.

Calendario de gestión de colonias de ratones

Para crear un calendario de gestión de colonias de ratones:

Servicios de información reproductiva

Realice el curso de Manejo de colonias reproductoras de ratones a través de la capacitación RARC

BRMS Mouse Breeding Core Colony Management puede proporcionarle colonias de reproducción confiables, económicas y eficientes de ratones para respaldar proyectos de investigación.

Genotipado e identificación
Consulte la política UW -4096, Genotipado de ratones y ratas

Transnetyx es una empresa de diagnóstico molecular que ofrece un sistema automatizado de genotipado para cepas de ratón transgénicas, knockout y knockin.


Speed ​​Congenics

Ahorre hasta un año y medio de reproducción examinando la genética de fondo de sus animales de investigación y seleccionando aquellos con el porcentaje más alto del fondo deseado.

El análisis de Speed ​​Congenics proporciona un porcentaje del fondo preferido y el número de generación aproximado, y una recomendación de los animales que se utilizarán para el próximo ciclo de reproducción. Uso de la estrategia de reproducción congénica asistida por marcadores para producir ratones congénicos con & gt99% de pureza genética de la cepa receptora en la mitad del tiempo (5 generaciones, 1,25-1,5 años) en lugar de las 10 generaciones estándar, que pueden tardar 3 años o más.


Taller de manejo de colonias de ratones del Laboratorio Jackson (JAX)

Sinopsis del taller
Los ratones transgénicos con deleciones de genes dirigidas son fundamentales para la investigación biomédica, tanto para comprender la función de los genes como para modelar enfermedades humanas. La generación de ratones transgénicos y knock-out es un desafío técnico, pero igualmente, el cuidado de estos animales y el mantenimiento de las existencias es una práctica veterinaria especializada que requiere una formación avanzada. Este curso de conferencias de 3 días tiene como objetivo proporcionar una descripción general del manejo de colonias de ratones para la investigación biomédica avanzada.

El curso proporcionará capacitación en la teoría y la práctica del mantenimiento de colonias de ratones para producción e investigación. El programa está diseñado para científicos, administradores de colonias, técnicos de cuidado de animales y estudiantes que requieren una comprensión de los problemas relacionados con el manejo de la investigación animal y las colonias de producción.

Los temas incluyen:

  • Genética del ratón y tecnología transgénica
  • Nomenclatura de genes y cepas
  • Estrategias de crianza
  • Efectos de fondo genéticos sobre el fenotipo
  • Biología reproductiva del ratón de laboratorio.
  • Uso de tecnologías de reproducción asistida (ART)
  • Criopreservación
  • Salud de la colonia
  • Importación
  • Recuperarse de brotes de enfermedades
  • Construcción y mantenimiento de colonias de producción
  • Nutrición
  • Control de calidad genética
  • Recursos públicos para investigadores de ratones
  • Tecnología Cre-LOX en modelos de enfermedad de ratón
  • Software informático JAX Colony Management System (JCMS)

Cartel y horario del taller

Para el póster, haga clic aquí - descargue el póster
Para obtener un calendario detallado del taller, haga clic aquí - calendario de descarga

Detalles de registro

Cuota de inscripción:
Estudiantes: Rs.2000
Post docs / Facultad: Rs. 6000
No académicos / Industria: Rs. 10,000

La tarifa de inscripción cubrirá el acceso a todas las sesiones científicas, almuerzos y cenas oficiales, té y refrigerios, material de oficina y materiales del curso. También se proporcionará alojamiento en alojamiento compartido. Tenga en cuenta que el espacio es limitado y se ofrecerá por orden de llegada. Si el inscrito necesita buscar o desear alojamiento en una habitación individual, debe permanecer fuera del sitio y transportarse al curso. No se puede hacer ninguna reducción en la tarifa de registro para el alojamiento fuera del sitio.

Formulario de registro y envío

Para registrarse, descargue el formulario de registro anterior, complete y envíe una copia impresa junto con el pago correspondiente por mensajería a:

A la atención de: Sra. Archana Jain
Instituto de Biología de Células Madre y Medicina Regenerativa (InStem)
Centro Nacional de Ciencias Biológicas (NCBS-TIFR)
Puesto G.K.V.K, Bellary Rd
Bangalore 560065, India.

Para que los formularios de registro nos lleguen por el 10 de febrero, envíe también su formulario de registro como archivo adjunto a archanaj [at] ncbs.res.in y ambikan [at] ncbs.res.in.

Los registrantes exitosos y no exitosos serán notificados por el 21 de febrero para que los de fuera de Bangalore también puedan finalizar sus planes de viaje para el curso.

Los borradores de demanda que se han recibido de los solicitantes no seleccionados, serán devueltos después de la 21 de febrero.

Hay un límite de 75 personas y se espera que el taller tenga demanda, por lo que se recomienda la inscripción temprana.

FECHA LÍMITE DE INSCRIPCIÓN ES 10 de febrero de 2011

Contacto para consultas sobre el registro: archanaj [at] ncbs.res.in y ambikan [at] ncbs.res.in

Detalles del pago

El pago debe hacerse ÚNICAMENTE mediante un giro bancario a la vista (DD) pagadero en Bangalore a "The Institute for Stem Cell Biology and Regenerative Medicine".


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