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Comparación de la relación de homología entre diferentes especies

Comparación de la relación de homología entre diferentes especies


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Encontré la siguiente relación de homología:

genes que codifican proteínas del organismo con un homólogo en el ratón / todos los genes que codifican proteínas en el organismo

He hecho esto para todos los genes que codifican proteínas entre varios organismos y ratones utilizando un enfoque basado en filogenia. ¡He notado que la proporción encontrada entre un organismo y un ratón es mayor que la proporción entre otro organismo y un ratón! Por otro lado, el segundo es evolutivamente más cercano al mouse que el primero.

¿Este enfoque intenta cuantificar la homología? Lo que sé que no es correcto ya que la homología es una medida cualitativa.

2. ¿Podemos comparar la relación de homología entre las 2 parejas de especies anteriores o tal comparación está sesgada?

3. ¿No debería la relación de homología ser proporcional a la distancia evolutiva de los organismos (según la conservación)?

Como puede comprender, en la forma en que calculo la relación anterior, ¡no tomo en cuenta las relaciones de uno a muchos o de muchos a muchos! Solo tomo en cuenta los genes que tienen al menos un homólogo en el ratón… ¿es ese el sesgo de mi cálculo?


¿Este enfoque intenta cuantificar la homología? Lo que sé que no es correcto ya que la homología es una medida cualitativa.

Un enfoque común para identificar ortólogos (homología entre dos genes resultantes de un evento de especiación) es la 'mejor coincidencia bidireccional': si ataca el gen A (en la especie 1) contra todos los genes de la especie 2, la mejor coincidencia es el gen B, y si ataca el gen B contra todos los genes de la especie 1, la mejor coincidencia es el gen A.

2. ¿Podemos comparar la relación de homología entre las 2 parejas de especies anteriores o tal comparación está sesgada?

3. ¿No debería la relación de homología ser proporcional a la distancia evolutiva de los organismos (según la conservación)?

No necesariamente. El hecho de que dos genes hayan divergido hace mucho tiempo no impide que sean homólogos. La homología tiene que ver con la ascendencia compartida (aquí de dos genes) y no con la distancia evolutiva.

¿Podría aclarar cómo se obtienen las homologías? ¿Los calculó usted mismo (si es así, cómo) o utilizó una base de datos específica?


Ver el vídeo: Una aproximación geométrica a la variación morfológica en insectos (Diciembre 2022).